{"id":859,"date":"2018-12-21T12:47:06","date_gmt":"2018-12-21T12:47:06","guid":{"rendered":"http:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/?p=859"},"modified":"2019-01-08T14:29:17","modified_gmt":"2019-01-08T14:29:17","slug":"leina-per-excellencia-es-la-bioinformatica-el-meu-primer-congres","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/2018\/12\/21\/leina-per-excellencia-es-la-bioinformatica-el-meu-primer-congres\/","title":{"rendered":"L’eina per excel\u00b7l\u00e8ncia \u00e9s la bioinform\u00e0tica? El meu primer congr\u00e9s!"},"content":{"rendered":"\n

Entre els dies 18 i 19 (dimarts i dimecres) de desembre nosaltres, tot l’alumat de 4t ESO de l’Institut Viladomat, v\u00e0rem inaugurar el primer congr\u00e9s de l’Institut Viladomat. En altres paraules, simplement v\u00e0rem fer un congr\u00e9s “cient\u00edfic”. Despr\u00e9s de dues situacions intenses, arriba el congr\u00e9s, un punt de tranquil\u00b7litat per alguns i per altres una setmana d’estr\u00e8s, en el meu cas tranquil\u00b7litat. Una setmana estudiant el tema que m\u00e9s t’agrada per despr\u00e9s fer una pon\u00e8ncia i un p\u00f2ster, jo ho considero tranquil\u00b7litat.<\/p>\n\n\n\n

Deixant de banda el que jo considero, per fer aquest meravell\u00f3s congr\u00e9s, la primera edici\u00f3 del congr\u00e9s cient\u00edfic a l’Institut Viladomat, la setmana pr\u00e8via al congr\u00e9s, vam triar un tema (en el cas del meu grup vam escollir la bioinform\u00e0tica). Un cop triat aquest tema el vam estudiar per poder fer una pon\u00e8ncia del que hav\u00edem estudiat o investigat i un p\u00f2ster amb la selecci\u00f3 de la informaci\u00f3 m\u00e9s important. Com ja he dit, jo i el meu grup (compost per en Gabriel Foucault, Esteve Escol\u00e0 Arnau de Ferrer i jo, Josep Salomon) vam estudiar el tema de la bioinform\u00e0tica, m\u00e9s ben dit vam fer una investigaci\u00f3 a partir de la bioinform\u00e0tica. Aquesta, consistia a intentar trobar un gen (a partir d’eines bioinform\u00e0tiques) per poder investigar les malalties neurodegeneratives com ho s\u00f3n l’Alzheimer i el Parkinson. <\/p>\n\n\n\n

Entrant m\u00e9s en detall el que nosaltres hem fet i hem exposat en aquest congr\u00e9s ha estat una investigaci\u00f3 per trobar un gen candidat que, exerc\u00eds un paper en les malalties neurodegeneratives (mitjan\u00e7ant la promoci\u00f3 o atenuaci\u00f3 del proc\u00e9s). Per aix\u00f2, hem partit de les dades Microrrays dels pacients (els Microrrays \u00e9s un m\u00e8tode per estudiar l\u2019expressi\u00f3 g\u00e8nica de molts gens a la vegada) per comparar el nivell d’expressi\u00f3 de cada gen entre els diferents pacients tenint en compte quin estil de vida i h\u00e0bits tenien, els casos familiars en la relaci\u00f3 (s’ha de destacar que aquestes dades eren reals i uns cient\u00edfics ens van facilitar les dades). Un cop vam haver comparat l’expressi\u00f3 dels gens v\u00e0rem fer 5 hip\u00f2tesis dels gens (Gri-7, Ant-6, Utb-6, pol-4 i Snf-4) que en un primer moment es va pensar que podrien ser candidats per a exercir un paper (promotor o recessor) en les malalties neurodegeneratives. Tot seguit, vam comen\u00e7ar el pas seg\u00fcent, obtenir informaci\u00f3 de la seq\u00fc\u00e8ncia dels gens seleccionats per aix\u00ed descobrir si el paper biol\u00f2gic d’algun dels gens dels quals s\u2019havia fet hip\u00f2tesi podia estar relacionat amb les malalties neurodegeneratives o ens hav\u00edem equivocat i hav\u00edem de tornar a comen\u00e7ar un altre cop i tornar a fer les hip\u00f2tesis. <\/p>\n\n\n\n

Aix\u00ed doncs, v\u00e0rem buscar la seq\u00fc\u00e8ncia del gen seleccionat (amb l\u2019ajuda d\u2019una aplicaci\u00f3 bioinform\u00e0tica) i, investigar si hi havia prote\u00efnes hom\u00f2logues en el ratol\u00ed (Mus musculus) i quin paper biol\u00f2gic exercien aquests gens en el ratol\u00ed mitjan\u00e7ant l’an\u00e0lisi de les seves dades bioqu\u00edmiques i els patrons d’expressi\u00f3. (Si es trobava un gen hom\u00f2leg al Mus musculus, era molt probable que desenvolup\u00e9s funcions similars en el Mus musculus i en els humans i aix\u00f2, ens donava una pista sobre la funci\u00f3 del gen estudiat). Primer vam trobar la traducci\u00f3 m\u00e9s consistent de l’ADN complementari. Un cop aix\u00f2, vam trobar els gens hom\u00f2legs que codifiquen prote\u00efnes hom\u00f2logues en Mus musculus, amb l’ajut de l’eina de recerca NCBI (una eina de la bioinform\u00e0tica) per buscar altres prote\u00efnes similars en el ratol\u00ed (Mus musculus). En fer aix\u00f2, vam seleccionar la puntuaci\u00f3 m\u00e9s alta (percentatge m\u00e9s alt de gen hom\u00f2leg) del Mus musculus. En seleccionar aquest, v\u00e0rem buscar informaci\u00f3 sobre el seu paper biol\u00f2gic (si tenia relaci\u00f3 amb la neurodegeneraci\u00f3). Vam comprovar clarament que l’\u00fanic gen que tenia relaci\u00f3 amb la neurogeneraci\u00f3 era el Snf-4, el qual produ\u00efa una prote\u00efna metal\u00b7lotione\u00efna-3 que tenia un gen 62% hom\u00f2leg en els humans, el MT3.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
    Buscador Big Data NCBI de prote\u00efnes on es pot observar l\u2019homologia dels humans amb altres esp\u00e8cies. <\/strong>
<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n

Amb aquest pas, nosaltres, vam concloure aquesta investigaci\u00f3, ja que hav\u00edem trobat el gen candidat a exercir un paper amb les malalties neurodegeneratives i, a m\u00e9s a m\u00e9s el seg\u00fcent pas s’hauria de dur a terme en un laboratori, el qual seria estudiar amb ratolins Mus musculus i el seu comportament a partir del gen MT3 gr\u00e0cies a la seva homologia del 62%, per\u00f2 nosaltres no v\u00e0rem tenir ni el temps ni les eines suficients per fer-ho.<\/p>\n\n\n\n

Ara que ja sabeu detalladament el tema que nosaltres v\u00e0rem exposar en el congr\u00e9s, explicar\u00e9 el que hav\u00edem de fer per presentar-nos en aquest esdeveniment. Primer de tot, el que v\u00e0rem fer va ser presentar un “abstract” als organitzadors del congr\u00e9s perqu\u00e8 aix\u00ed ells sabessin del tema del qual parlar\u00edem. Posteriorment, un cop acabada la investigaci\u00f3 que nosaltres vam fer, v\u00e0rem entregar un text acad\u00e8mic o article explicant tota la nostra recerca. Finalment el dia del congr\u00e9s vam presentar una pon\u00e8ncia i un p\u00f2ster anteriorment fets.<\/p>\n\n\n\n

Veritablement, penso que ha estat una activitat molt entretinguda i la repetiria molts cops, perqu\u00e8 hem apr\u00e8s moltes coses noves tant dels temes exposats com de valors. Tot i aix\u00f2, he de dir que les r\u00fabriques utilitzades, des del meu punt de vista i el dels meus companys de treball \u00e9s que no estaven ben fetes, ja que nom\u00e9s avaluaven la forma (que \u00e9s molt important) per\u00f2 deixaven de banda el contingut. En aquest aspecte el meu grup i jo no estem gaire contents, ja que nosaltres v\u00e0rem treballar molt i aprendre moltes coses noves i aplicar la nostra l\u00f2gica en la investigaci\u00f3 i en canvi altres grups, es van limitar a mirar o fins i tot a quasi copiar algunes p\u00e0gines web com la Viquip\u00e8dia entre altres no tan conegudes. No nom\u00e9s aix\u00f2, sin\u00f3 que tamb\u00e9 alguns grups varen copiar literalment una activitat feta a classe sense ampliar ni modificar l’activitat.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Entre els dies 18 i 19 (dimarts i dimecres) de desembre nosaltres, tot l’alumat de 4t ESO de l’Institut Viladomat, v\u00e0rem inaugurar el primer congr\u00e9s de l’Institut Viladomat. En altres…<\/p>\n","protected":false},"author":16,"featured_media":861,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[78,1,82],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/859"}],"collection":[{"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/users\/16"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=859"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/859\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":872,"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/859\/revisions\/872"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/media\/861"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=859"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=859"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/institutviladomat.cat\/portfoli\/15josepsalomon\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=859"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}